Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV66

Ifi44, Interferon-induced protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi44Q8BV66 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi44Q8BV66 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ifi44Q8BV66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ifi44Q8BV66 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ifi44Q8BV66 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ifi44Q8BV66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms