Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp4f39Q8BGU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cyp4f39Q8BGU0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cyp4f39Q8BGU0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cyp4f39Q8BGU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cyp4f39Q8BGU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms