Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc181Q80ZU5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc181Q80ZU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc181Q80ZU5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc181Q80ZU5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc181Q80ZU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms