Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Uhrf2Q7TMI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Uhrf2Q7TMI3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Uhrf2Q7TMI3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Uhrf2Q7TMI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms