Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Ncapd3Q6ZQK0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Ncapd3Q6ZQK0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms