Protein–RNA interactions for Protein: Q6YCH1

Tdpoz5, TD and POZ domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdpoz5Q6YCH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tdpoz5Q6YCH1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tdpoz5Q6YCH1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tdpoz5Q6YCH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdpoz5Q6YCH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tdpoz5Q6YCH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdpoz5Q6YCH1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdpoz5Q6YCH1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdpoz5Q6YCH1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdpoz5Q6YCH1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms