Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prrt3Q6PE13 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prrt3Q6PE13 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrt3Q6PE13 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prrt3Q6PE13 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prrt3Q6PE13 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Prrt3Q6PE13 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prrt3Q6PE13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms