Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zbtb40Q6PCS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb40Q6PCS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zbtb40Q6PCS8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbtb40Q6PCS8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Zbtb40Q6PCS8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zbtb40Q6PCS8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms