Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bhlhb9Q6PB60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bhlhb9Q6PB60 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Bhlhb9Q6PB60 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Bhlhb9Q6PB60 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bhlhb9Q6PB60 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Bhlhb9Q6PB60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms