Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rexo4Q6PAQ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rexo4Q6PAQ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rexo4Q6PAQ4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rexo4Q6PAQ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rexo4Q6PAQ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rexo4Q6PAQ4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms