Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM1

Txlna, Alpha-taxilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnaQ6PAM1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TxlnaQ6PAM1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TxlnaQ6PAM1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TxlnaQ6PAM1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TxlnaQ6PAM1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TxlnaQ6PAM1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TxlnaQ6PAM1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TxlnaQ6PAM1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TxlnaQ6PAM1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TxlnaQ6PAM1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TxlnaQ6PAM1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms