Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cpa4Q6P8K8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cpa4Q6P8K8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cpa4Q6P8K8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cpa4Q6P8K8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cpa4Q6P8K8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cpa4Q6P8K8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms