Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ggnbp1Q6K1E7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ggnbp1Q6K1E7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ggnbp1Q6K1E7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ggnbp1Q6K1E7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ggnbp1Q6K1E7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ggnbp1Q6K1E7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ggnbp1Q6K1E7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms