Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn11Q6J756 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn11Q6J756 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn11Q6J756 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn11Q6J756 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms