Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt72Q6IME9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt72Q6IME9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt72Q6IME9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Krt72Q6IME9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt72Q6IME9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt72Q6IME9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms