Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cdk13Q69ZA1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk13Q69ZA1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cdk13Q69ZA1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cdk13Q69ZA1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cdk13Q69ZA1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.79■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Cdk13Q69ZA1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Cdk13Q69ZA1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms