Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltbp3Q61810 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltbp3Q61810 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltbp3Q61810 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltbp3Q61810 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltbp3Q61810 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ltbp3Q61810 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ltbp3Q61810 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ltbp3Q61810 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ltbp3Q61810 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ltbp3Q61810 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ltbp3Q61810 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms