Protein–RNA interactions for Protein: Q61142

Spin1, Spindlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin1Q61142 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spin1Q61142 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Spin1Q61142 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Spin1Q61142 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Spin1Q61142 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spin1Q61142 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms