Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI2

Slc44a5, Choline transporter-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a5Q5RJI2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc44a5Q5RJI2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc44a5Q5RJI2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc44a5Q5RJI2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a5Q5RJI2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a5Q5RJI2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms