Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rtp3Q5QGU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rtp3Q5QGU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtp3Q5QGU6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rtp3Q5QGU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rtp3Q5QGU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rtp3Q5QGU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtp3Q5QGU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rtp3Q5QGU6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rtp3Q5QGU6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms