Protein–RNA interactions for Protein: Q5G866

Defa23, Alpha-defensin 23, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa23Q5G866 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa23Q5G866 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa23Q5G866 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa23Q5G866 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa23Q5G866 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa23Q5G866 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa23Q5G866 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa23Q5G866 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.7 ms