Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q5EBG8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5EBG8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5EBG8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q5EBG8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q5EBG8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q5EBG8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5EBG8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q5EBG8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q5EBG8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q5EBG8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q5EBG8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q5EBG8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q5EBG8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q5EBG8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q5EBG8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q5EBG8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q5EBG8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q5EBG8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms