Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sfmbt2Q5DTW2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sfmbt2Q5DTW2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sfmbt2Q5DTW2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sfmbt2Q5DTW2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sfmbt2Q5DTW2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sfmbt2Q5DTW2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms