Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eme2Q56A04 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Eme2Q56A04 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Eme2Q56A04 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eme2Q56A04 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eme2Q56A04 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Eme2Q56A04 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Eme2Q56A04 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Eme2Q56A04 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Eme2Q56A04 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Eme2Q56A04 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Eme2Q56A04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Eme2Q56A04 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms