Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd28Q505D1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd28Q505D1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ankrd28Q505D1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd28Q505D1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd28Q505D1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd28Q505D1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ankrd28Q505D1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ankrd28Q505D1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ankrd28Q505D1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ankrd28Q505D1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd28Q505D1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd28Q505D1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms