Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otol1Q4ZJM7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otol1Q4ZJM7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otol1Q4ZJM7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otol1Q4ZJM7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Otol1Q4ZJM7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Otol1Q4ZJM7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Otol1Q4ZJM7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Otol1Q4ZJM7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms