Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ulk4Q3V129 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ulk4Q3V129 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ulk4Q3V129 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ulk4Q3V129 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ulk4Q3V129 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ulk4Q3V129 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ulk4Q3V129 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms