Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
4930567H17RikQ3V0K5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
4930567H17RikQ3V0K5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
4930567H17RikQ3V0K5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
4930567H17RikQ3V0K5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
4930567H17RikQ3V0K5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
4930567H17RikQ3V0K5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
4930567H17RikQ3V0K5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
4930567H17RikQ3V0K5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
4930567H17RikQ3V0K5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
4930567H17RikQ3V0K5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
4930567H17RikQ3V0K5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
4930567H17RikQ3V0K5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
4930567H17RikQ3V0K5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms