Protein–RNA interactions for Protein: Q3V079

Bbof1, Basal body-orientation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbof1Q3V079 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Bbof1Q3V079 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Bbof1Q3V079 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Bbof1Q3V079 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Bbof1Q3V079 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Bbof1Q3V079 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bbof1Q3V079 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bbof1Q3V079 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms