Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cnga4Q3UW12 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnga4Q3UW12 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cnga4Q3UW12 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga4Q3UW12 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga4Q3UW12 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga4Q3UW12 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms