Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm29609Q3UU56 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29609Q3UU56 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm29609Q3UU56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm29609Q3UU56 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm29609Q3UU56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms