Protein–RNA interactions for Protein: Q3URQ4

Fam8a1, Family with sequence similarity 8, member A1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam8a1Q3URQ4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fam8a1Q3URQ4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam8a1Q3URQ4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam8a1Q3URQ4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam8a1Q3URQ4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam8a1Q3URQ4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam8a1Q3URQ4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms