Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ41

Tmprss11a, Transmembrane protease serine 11A, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11aQ3UQ41 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss11aQ3UQ41 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss11aQ3UQ41 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tmprss11aQ3UQ41 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tmprss11aQ3UQ41 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmprss11aQ3UQ41 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms