Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL6

Ms4a15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a15Q3UPL6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a15Q3UPL6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ms4a15Q3UPL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ms4a15Q3UPL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ms4a15Q3UPL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms