Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ceacam5Q3UKK2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ceacam5Q3UKK2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ceacam5Q3UKK2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ceacam5Q3UKK2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ceacam5Q3UKK2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ceacam5Q3UKK2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ceacam5Q3UKK2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms