Protein–RNA interactions for Protein: Q2TB02

Nfkbid, NF-kappa-B inhibitor delta, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbidQ2TB02 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NfkbidQ2TB02 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbidQ2TB02 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NfkbidQ2TB02 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbidQ2TB02 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbidQ2TB02 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbidQ2TB02 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbidQ2TB02 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbidQ2TB02 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbidQ2TB02 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms