Protein–RNA interactions for Protein: Q12380

ATG5, Autophagy protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG5Q12380 VBA3YCL069W 1377 nt6.78□□□□□ -1.32
ATG5Q12380 YJL009WYJL009W 327 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 KRE1YNL322C 942 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 STE4YOR212W 1272 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YPL264CYPL264C 1062 nt6.77□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YKR012CYKR012C 378 nt6.76□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 MEP1YGR121C 1479 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 LYS20YDL182W 1287 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 CPD1YGR247W 720 nt6.75□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 MAM3YOL060C 2121 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YNL040WYNL040W 1371 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 PHB2YGR231C 933 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YIR035CYIR035C 765 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 BUB2YMR055C 921 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 MAS2YHR024C 1449 nt6.74□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YJR149WYJR149W 1215 nt6.73□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 ADE2YOR128C 1716 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 AQR1YNL065W 1761 nt6.72□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 HXT13YEL069C 1695 nt6.71□□□□□ -1.33
ATG5Q12380 YFR020WYFR020W 699 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 RSM7YJR113C 744 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 ADH3YMR083W 1128 nt6.71□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 BUD31YCR063W 474 nt6.7□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 MRN1YPL184C 1839 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 NDE2YDL085W 1638 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 GLY1YEL046C 1164 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 IGD1YFR017C 588 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 HXT9YJL219W 1704 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 TIF3YPR163C 1311 nt6.69□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 MSB3YNL293W 1902 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 SAM50YNL026W 1455 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 WSC4YHL028W 1818 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 YER152CYER152C 1332 nt6.68□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 YNL140CYNL140C 570 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 INO1YJL153C 1602 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 ENO1YGR254W 1314 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 MCM5YLR274W 2328 nt6.67□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 DIP5YPL265W 1827 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 LRO1YNR008W 1986 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 POB3YML069W 1659 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 RNA170RNA170 169 nt6.66□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 RAD51YER095W 1203 nt6.65□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 PAU5YFL020C 369 nt6.65□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 PGC1YPL206C 966 nt6.65□□□□□ -1.34
ATG5Q12380 EHT1YBR177C 1356 nt6.65□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 TGL5YOR081C 2250 nt6.65□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 RRT6YGL146C 936 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 INM1YHR046C 888 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 MAS1YLR163C 1389 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 MET13YGL125W 1803 nt6.64□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 MOB1YIL106W 945 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 TDA4YJR116W 840 nt6.63□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 SNU66YOR308C 1764 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 ADH7YCR105W 1086 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 FLX1YIL134W 936 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 STP3YLR375W 1032 nt6.62□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 FCP1YMR277W 2199 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 SGF73YGL066W 1974 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 MET22YOL064C 1074 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 CDC13YDL220C 2775 nt6.61□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 YLR460CYLR460C 1131 nt6.6□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 SRP102YKL154W 735 nt6.59□□□□□ -1.35
ATG5Q12380 YBL111CYBL111C 2004 nt6.59□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 CHS7YHR142W 951 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 PAU15YIR041W 375 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 YBR232CYBR232C 360 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 PDC6YGR087C 1692 nt6.58□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 KTR4YBR199W 1395 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 ALG7YBR243C 1347 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 ARO3YDR035W 1113 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 YLR280CYLR280C 351 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 RCF1YML030W 480 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 IPL1YPL209C 1104 nt6.57□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 PMT1YDL095W 2454 nt6.56□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 WSC3YOL105C 1671 nt6.56□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 CYC3YAL039C 810 nt6.56□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 MRP7YNL005C 1116 nt6.55□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 OLA1YBR025C 1185 nt6.55□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 OCH1YGL038C 1443 nt6.54□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 ERO1YML130C 1692 nt6.54□□□□□ -1.36
ATG5Q12380 SHC1YER096W 1539 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG5Q12380 PUP3YER094C 618 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG5Q12380 YER137CYER137C 447 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG5Q12380 RHO1YPR165W 630 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG5Q12380 HXT8YJL214W 1710 nt6.52□□□□□ -1.37
ATG5Q12380 RSC9YML127W 1746 nt6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms