Protein–RNA interactions for Protein: Q12256

TPO4, Polyamine transporter 4, yeastyeast

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPO4Q12256 YFR020WYFR020W 699 nt7.55□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 AAC3YBR085W 924 nt7.55□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 TOM71YHR117W 1920 nt7.54□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.54□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 EMC3YKL207W 762 nt7.54□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 HXT11YOL156W 1704 nt7.54□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 YJL160CYJL160C 864 nt7.53□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 MDL2YPL270W 2322 nt7.52□□□□□ -1.2
TPO4Q12256 MIM1YOL026C 342 nt7.52□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 TMS1YDR105C 1422 nt7.52□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 snR86snR86 1004 nt7.5□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 RSM7YJR113C 744 nt7.5□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 YIL177CYIL177C 5277 nt7.49□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.49□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 MRP1YDR347W 966 nt7.49□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 YJL009WYJL009W 327 nt7.49□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 MAS1YLR163C 1389 nt7.48□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 YMR166CYMR166C 1107 nt7.48□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 HBS1YKR084C 1836 nt7.48□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 YMR210WYMR210W 1350 nt7.47□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 SRM1YGL097W 1449 nt7.46□□□□□ -1.21
TPO4Q12256 ORT1YOR130C 879 nt7.46□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YLR072WYLR072W 2082 nt7.46□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 MEX67YPL169C 1800 nt7.45□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.44□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YIR035CYIR035C 765 nt7.44□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YOR268CYOR268C 399 nt7.44□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 LSP1YPL004C 1026 nt7.44□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 ALR1YOL130W 2580 nt7.43□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YJR149WYJR149W 1215 nt7.43□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 BUB2YMR055C 921 nt7.43□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 NSG2YNL156C 900 nt7.43□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 GDH1YOR375C 1365 nt7.43□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 EDC2YER035W 438 nt7.42□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 RRT14YIL127C 621 nt7.42□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YBR056WYBR056W 1506 nt7.42□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YLR460CYLR460C 1131 nt7.41□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 LEA1YPL213W 717 nt7.41□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 LPD1YFL018C 1500 nt7.41□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 MFT1YML062C 1179 nt7.4□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 ADA2YDR448W 1305 nt7.4□□□□□ -1.22
TPO4Q12256 YER156CYER156C 1017 nt7.39□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 HIS3YOR202W 663 nt7.39□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 MEP1YGR121C 1479 nt7.38□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 FTH1YBR207W 1398 nt7.38□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 DUR3YHL016C 2208 nt7.38□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 PET18YCR020C 648 nt7.38□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 CAK1YFL029C 1107 nt7.38□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 snR4snR4 186 nt7.38□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 YLR173WYLR173W 1827 nt7.37□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 CHS7YHR142W 951 nt7.37□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 TAD2YJL035C 753 nt7.37□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 OCH1YGL038C 1443 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 ABP1YCR088W 1779 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 MFG1YDL233W 1377 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 UFD1YGR048W 1086 nt7.36□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 MET22YOL064C 1074 nt7.34□□□□□ -1.23
TPO4Q12256 UTR5YEL035C 501 nt7.33□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 YPR084WYPR084W 1371 nt7.33□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 OLA1YBR025C 1185 nt7.32□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 ELP4YPL101W 1371 nt7.32□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 PDC6YGR087C 1692 nt7.32□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 DIA4YHR011W 1341 nt7.31□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 NDE2YDL085W 1638 nt7.31□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 INO1YJL153C 1602 nt7.31□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 BUD31YCR063W 474 nt7.31□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 RTG2YGL252C 1767 nt7.29□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 TIF3YPR163C 1311 nt7.28□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 RNA170RNA170 169 nt7.28□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 YNL140CYNL140C 570 nt7.28□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 BXI1YNL305C 894 nt7.28□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 FIT1YDR534C 1587 nt7.28□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 ADE16YLR028C 1776 nt7.28□□□□□ -1.24
TPO4Q12256 ADE1YAR015W 921 nt7.27□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 RPS6AYPL090C 711 nt7.27□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 RPS6BYBR181C 711 nt7.27□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 ATP2YJR121W 1536 nt7.27□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 GNP1YDR508C 1992 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 INM1YHR046C 888 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 TDH1YJL052W 999 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 KAE1YKR038C 1161 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 RCF1YML030W 480 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 FUS3YBL016W 1062 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 YMR206WYMR206W 942 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 DUS3YLR401C 2007 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 TGL5YOR081C 2250 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 LRO1YNR008W 1986 nt7.26□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 TOS1YBR162C 1368 nt7.25□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 GLY1YEL046C 1164 nt7.25□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 TDA4YJR116W 840 nt7.25□□□□□ -1.25
TPO4Q12256 EHT1YBR177C 1356 nt7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.1 ms