Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms