Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG34

4930480E11Rik, MCG52719, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930480E11RikQ0VG34 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930480E11RikQ0VG34 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4930480E11RikQ0VG34 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4930480E11RikQ0VG34 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
4930480E11RikQ0VG34 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4930480E11RikQ0VG34 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms