Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smim24Q0VG18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smim24Q0VG18 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim24Q0VG18 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim24Q0VG18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms