Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Caprin2Q05A80 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caprin2Q05A80 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Caprin2Q05A80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Caprin2Q05A80 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Caprin2Q05A80 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms