Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnd1Q03719 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnd1Q03719 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Kcnd1Q03719 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kcnd1Q03719 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kcnd1Q03719 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnd1Q03719 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms