Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gata5P97489 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gata5P97489 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gata5P97489 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gata5P97489 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gata5P97489 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gata5P97489 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata5P97489 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata5P97489 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gata5P97489 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gata5P97489 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata5P97489 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata5P97489 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata5P97489 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gata5P97489 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gata5P97489 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gata5P97489 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms