Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Stra8P70278 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Stra8P70278 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Stra8P70278 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Stra8P70278 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Stra8P70278 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Stra8P70278 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Stra8P70278 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Stra8P70278 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Stra8P70278 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Stra8P70278 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
Stra8P70278 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stra8P70278 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Stra8P70278 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Stra8P70278 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Stra8P70278 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Stra8P70278 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Stra8P70278 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Stra8P70278 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Stra8P70278 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Stra8P70278 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Stra8P70278 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Stra8P70278 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Stra8P70278 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Stra8P70278 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Stra8P70278 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Stra8P70278 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Stra8P70278 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Stra8P70278 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Stra8P70278 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Stra8P70278 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms