Protein–RNA interactions for Protein: P70190

Capza3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza3P70190 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capza3P70190 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capza3P70190 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capza3P70190 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Capza3P70190 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capza3P70190 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capza3P70190 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capza3P70190 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capza3P70190 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capza3P70190 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Capza3P70190 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capza3P70190 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capza3P70190 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Capza3P70190 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Capza3P70190 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Capza3P70190 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Capza3P70190 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Capza3P70190 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Capza3P70190 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capza3P70190 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Capza3P70190 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capza3P70190 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capza3P70190 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Capza3P70190 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Capza3P70190 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms