Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SbdsP70122 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SbdsP70122 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SbdsP70122 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SbdsP70122 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SbdsP70122 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SbdsP70122 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SbdsP70122 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SbdsP70122 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SbdsP70122 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SbdsP70122 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SbdsP70122 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SbdsP70122 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SbdsP70122 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SbdsP70122 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SbdsP70122 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SbdsP70122 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SbdsP70122 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SbdsP70122 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SbdsP70122 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SbdsP70122 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SbdsP70122 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SbdsP70122 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SbdsP70122 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SbdsP70122 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SbdsP70122 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms