Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hmgb1P63158 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hmgb1P63158 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hmgb1P63158 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgb1P63158 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgb1P63158 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgb1P63158 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms