Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CgnP59242 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CgnP59242 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CgnP59242 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CgnP59242 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CgnP59242 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CgnP59242 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CgnP59242 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CgnP59242 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CgnP59242 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CgnP59242 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CgnP59242 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CgnP59242 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CgnP59242 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CgnP59242 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CgnP59242 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CgnP59242 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CgnP59242 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CgnP59242 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CgnP59242 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CgnP59242 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CgnP59242 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CgnP59242 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CgnP59242 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CgnP59242 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CgnP59242 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CgnP59242 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CgnP59242 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CgnP59242 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CgnP59242 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CgnP59242 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CgnP59242 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CgnP59242 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CgnP59242 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CgnP59242 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CgnP59242 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CgnP59242 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CgnP59242 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CgnP59242 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CgnP59242 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CgnP59242 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CgnP59242 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CgnP59242 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CgnP59242 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CgnP59242 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CgnP59242 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CgnP59242 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CgnP59242 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CgnP59242 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CgnP59242 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CgnP59242 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CgnP59242 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CgnP59242 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CgnP59242 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CgnP59242 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CgnP59242 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CgnP59242 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CgnP59242 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CgnP59242 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CgnP59242 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CgnP59242 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CgnP59242 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CgnP59242 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CgnP59242 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CgnP59242 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CgnP59242 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CgnP59242 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CgnP59242 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CgnP59242 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CgnP59242 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CgnP59242 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CgnP59242 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CgnP59242 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CgnP59242 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CgnP59242 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CgnP59242 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CgnP59242 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CgnP59242 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CgnP59242 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CgnP59242 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CgnP59242 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CgnP59242 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CgnP59242 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CgnP59242 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CgnP59242 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CgnP59242 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CgnP59242 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CgnP59242 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CgnP59242 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CgnP59242 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CgnP59242 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CgnP59242 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CgnP59242 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CgnP59242 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CgnP59242 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CgnP59242 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CgnP59242 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CgnP59242 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CgnP59242 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CgnP59242 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms