Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Gsc2P56916 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gsc2P56916 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gsc2P56916 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gsc2P56916 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gsc2P56916 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gsc2P56916 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gsc2P56916 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gsc2P56916 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gsc2P56916 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gsc2P56916 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gsc2P56916 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms