Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gp1bbP56400 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gp1bbP56400 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gp1bbP56400 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gp1bbP56400 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gp1bbP56400 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gp1bbP56400 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gp1bbP56400 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms